More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2950 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  100 
 
 		 315 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  61.36 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0442  alpha/beta hydrolase fold  56.07 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  50.66 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 		 267 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  28.19 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49119  predicted protein  27.99 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00923663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  30.96 
 
 		 267 aa  89  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  25.28 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  24.89 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  23.76 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  23.84 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  28.75 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  27.91 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  22.7 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  21.83 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  22.82 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  21.86 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  21.2 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  21.83 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  33.65 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  22.11 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  25 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  21.83 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  23.08 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  23 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  23.87 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  34.44 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  23.46 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.58 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  23.08 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  33.04 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2266  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  23.46 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>