More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1648 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.98 
 
 
295 aa  349  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1443  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.59 
 
 
295 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.810635  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.41 
 
 
264 aa  279  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.92 
 
 
263 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.62 
 
 
268 aa  268  8.999999999999999e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.82 
 
 
265 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.82 
 
 
264 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
278 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.27 
 
 
278 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.91 
 
 
262 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.73 
 
 
268 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.92 
 
 
265 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.45 
 
 
267 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.27 
 
 
266 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.49 
 
 
269 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.64 
 
 
267 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.08 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.72 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.44 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.06 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.64 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.29 
 
 
267 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.44 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.31 
 
 
278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.31 
 
 
278 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.38 
 
 
270 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.74 
 
 
258 aa  251  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.74 
 
 
258 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.4 
 
 
272 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.64 
 
 
267 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.34 
 
 
265 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.94 
 
 
277 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.94 
 
 
277 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.34 
 
 
270 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.67 
 
 
267 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.35 
 
 
279 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.23 
 
 
267 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.96 
 
 
265 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.91 
 
 
266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48 
 
 
271 aa  245  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.16 
 
 
264 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.45 
 
 
271 aa  244  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.42 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.6 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.64 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.29 
 
 
270 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.27 
 
 
266 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.6 
 
 
262 aa  237  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.94 
 
 
277 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.18 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.22 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 
270 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.64 
 
 
271 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.43 
 
 
268 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.79 
 
 
271 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
279 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.11 
 
 
263 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.71 
 
 
262 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.11 
 
 
263 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.72 
 
 
266 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.06 
 
 
268 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.29 
 
 
278 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.18 
 
 
268 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.25 
 
 
266 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.41 
 
 
270 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.65 
 
 
271 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.29 
 
 
287 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
265 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
285 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.89 
 
 
270 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.67 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.77 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
276 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.17 
 
 
285 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.62 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 
285 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.54 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.81 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.890478  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.69 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.69 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.69 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  45.35 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 
261 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
262 aa  212  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.69 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.19 
 
 
261 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  45.42 
 
 
268 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3618  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.96 
 
 
261 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3219  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.17 
 
 
264 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.19 
 
 
261 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.59 
 
 
266 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.28 
 
 
263 aa  208  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
265 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
267 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 
269 aa  208  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>