83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1080 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  52.74 
 
 		 577 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 590 aa  1234    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  52.9 
 
 		 579 aa  638    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  57.22 
 
 		 571 aa  682    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  59.89 
 
 		 570 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  57.12 
 
 		 576 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  57.12 
 
 		 576 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  59.96 
 
 		 577 aa  745    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  57.04 
 
 		 571 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  57.22 
 
 		 571 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  59.03 
 
 		 566 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  59.79 
 
 		 571 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  57.4 
 
 		 571 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  63.77 
 
 		 567 aa  771    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  59.89 
 
 		 570 aa  701    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  57.12 
 
 		 576 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  60.07 
 
 		 570 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  57.4 
 
 		 571 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  57.04 
 
 		 571 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  56.94 
 
 		 576 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  57.12 
 
 		 576 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  52.67 
 
 		 579 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  57.22 
 
 		 571 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  53.87 
 
 		 579 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  54.14 
 
 		 585 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  54.46 
 
 		 563 aa  652    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  57.4 
 
 		 571 aa  684    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  53.57 
 
 		 563 aa  659    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  52.55 
 
 		 579 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  52.68 
 
 		 596 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  60.04 
 
 		 568 aa  754    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  57.4 
 
 		 571 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  57.58 
 
 		 588 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  51.36 
 
 		 569 aa  614  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  51.52 
 
 		 590 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  52.4 
 
 		 568 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  50 
 
 		 584 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  47.76 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  47.03 
 
 		 559 aa  555  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  41.91 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  26.77 
 
 		 691 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  30.05 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.4 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 		 472 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 		 475 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.87 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  28.65 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 		 473 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.74 
 
 		 519 aa  50.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  29.89 
 
 		 470 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.58 
 
 		 474 aa  50.4  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  26.51 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.06 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  26.74 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  25.7 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 		 481 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 473 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.14 
 
 		 482 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  26.74 
 
 		 473 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.74 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2127  putative oxidoreductase  27.37 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  26.74 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.75 
 
 		 462 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.74 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.38 
 
 		 475 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  26.51 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  27.13 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.57 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.74 
 
 		 473 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.22 
 
 		 484 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0624  FAD linked oxidase-like protein  24.38 
 
 		 482 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.57 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  26.35 
 
 		 176 aa  45.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.31 
 
 		 469 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.49 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.86 
 
 		 472 aa  44.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.45 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  25.32 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.55 
 
 		 480 aa  43.9  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  26.83 
 
 		 487 aa  43.9  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>