More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0865 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.76 
 
 
472 aa  293  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  65.27 
 
 
472 aa  238  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  65.29 
 
 
474 aa  238  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.47 
 
 
475 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  61.68 
 
 
470 aa  233  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  61.68 
 
 
470 aa  233  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  63.47 
 
 
472 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  61.08 
 
 
470 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.46 
 
 
474 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  65.85 
 
 
489 aa  227  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  62.87 
 
 
473 aa  227  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.47 
 
 
472 aa  227  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  62.87 
 
 
468 aa  226  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.42 
 
 
473 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.42 
 
 
473 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  64.42 
 
 
473 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.42 
 
 
473 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  63.8 
 
 
473 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.8 
 
 
473 aa  223  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  62.87 
 
 
473 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  62.87 
 
 
473 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  62.87 
 
 
473 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  64.2 
 
 
477 aa  222  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  62.87 
 
 
473 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  62.87 
 
 
473 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.96 
 
 
476 aa  221  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  62.28 
 
 
524 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  62.28 
 
 
473 aa  220  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.88 
 
 
502 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  63.86 
 
 
472 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  61.45 
 
 
477 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  66.04 
 
 
473 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  60.49 
 
 
472 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.04 
 
 
480 aa  208  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.83 
 
 
519 aa  207  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.33 
 
 
472 aa  206  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  57.23 
 
 
468 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.43 
 
 
474 aa  205  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.27 
 
 
475 aa  197  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  56.29 
 
 
480 aa  195  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.1 
 
 
479 aa  194  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  58.54 
 
 
465 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2127  putative oxidoreductase  54.17 
 
 
465 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421585  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  53.29 
 
 
480 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.64 
 
 
472 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.95 
 
 
471 aa  191  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  53.37 
 
 
489 aa  191  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.32 
 
 
465 aa  190  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.69 
 
 
481 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  53.61 
 
 
472 aa  188  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  53.61 
 
 
475 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  56.71 
 
 
465 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  53.01 
 
 
478 aa  187  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  56.89 
 
 
471 aa  187  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  56.1 
 
 
475 aa  187  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  54.82 
 
 
478 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1420  putative oxidoreductase protein  63.1 
 
 
468 aa  185  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00835956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  50.9 
 
 
487 aa  184  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  54.49 
 
 
470 aa  184  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.49 
 
 
470 aa  184  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  52.38 
 
 
464 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  54.49 
 
 
470 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.83 
 
 
481 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  50.3 
 
 
470 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.66 
 
 
496 aa  181  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  57.14 
 
 
469 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  49.7 
 
 
470 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.6 
 
 
464 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
462 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  50.31 
 
 
476 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  55.56 
 
 
475 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.4 
 
 
479 aa  177  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  50.6 
 
 
474 aa  177  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.3 
 
 
473 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  48.21 
 
 
483 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.81 
 
 
483 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  50.6 
 
 
478 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.6 
 
 
477 aa  175  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  53.66 
 
 
474 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
475 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.44 
 
 
491 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  58.02 
 
 
484 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  51.53 
 
 
476 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  53.09 
 
 
489 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  53.09 
 
 
475 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  50 
 
 
469 aa  171  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.9 
 
 
489 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  49.07 
 
 
484 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.45 
 
 
480 aa  168  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  45.06 
 
 
471 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.2 
 
 
474 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  55.21 
 
 
478 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.15 
 
 
506 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.38 
 
 
464 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  47.8 
 
 
537 aa  157  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.5 
 
 
498 aa  154  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.07 
 
 
472 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  45.34 
 
 
463 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4872  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.58 
 
 
481 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>