More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4872 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4872  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  974    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  51.07 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.08 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.84 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.54 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  43.1 
 
 		 468 aa  362  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  45.94 
 
 		 469 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  43.71 
 
 		 487 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  42.86 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.53 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.09 
 
 		 483 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.11 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.23 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  42.71 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  40.9 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.29 
 
 		 475 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  42.8 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.28 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  42.47 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  41.68 
 
 		 470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  42.28 
 
 		 473 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.28 
 
 		 473 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  41.68 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  38.46 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  41.56 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  38.77 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  38.77 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  40.21 
 
 		 475 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.34 
 
 		 475 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  41.06 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.17 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.85 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  42.41 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.03 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  40.34 
 
 		 478 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.44 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  40.25 
 
 		 477 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  38.12 
 
 		 475 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.24 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.35 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.18 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  42.21 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  41.05 
 
 		 472 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  41.19 
 
 		 472 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.24 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.95 
 
 		 472 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.26 
 
 		 519 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  40.55 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.04 
 
 		 474 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.61 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42 
 
 		 472 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  42.2 
 
 		 524 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.45 
 
 		 474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.61 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 		 474 aa  320  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  40.69 
 
 		 465 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  38.11 
 
 		 470 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  38.82 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  42.19 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  42.19 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  42.19 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  42.19 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.16 
 
 		 481 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  42.19 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  42.19 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.48 
 
 		 470 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.26 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  41.84 
 
 		 484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  41.31 
 
 		 489 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  42.26 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  40.38 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  39.15 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  39.01 
 
 		 472 aa  309  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  39.62 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  38.15 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  37.9 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.21 
 
 		 498 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.71 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.61 
 
 		 479 aa  305  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  37 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  37.85 
 
 		 484 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.25 
 
 		 502 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.03 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.35 
 
 		 465 aa  299  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  40.31 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4478  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.96 
 
 		 465 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408304  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1420  putative oxidoreductase protein  40.69 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00835956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2327  FAD linked oxidase-like  36.83 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352966  normal  0.977128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5003  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.23 
 
 		 477 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.541494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.05 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  35.16 
 
 		 463 aa  277  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.27 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 		 491 aa  273  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>