234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01510 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  56.64 
 
 		 571 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  56.46 
 
 		 571 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  56.64 
 
 		 571 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  54.39 
 
 		 568 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  56.64 
 
 		 571 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  57.35 
 
 		 576 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  57.45 
 
 		 570 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  57.47 
 
 		 579 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  57.35 
 
 		 576 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  54.66 
 
 		 568 aa  656    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  56.15 
 
 		 585 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  56.12 
 
 		 571 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  60.18 
 
 		 566 aa  728    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  55.34 
 
 		 563 aa  670    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 577 aa  1204    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  57.35 
 
 		 576 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  57.09 
 
 		 579 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  53.6 
 
 		 590 aa  646    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  56.64 
 
 		 571 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  56.23 
 
 		 563 aa  682    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  56.64 
 
 		 571 aa  682    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  57.45 
 
 		 570 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  54.09 
 
 		 569 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  54.47 
 
 		 567 aa  661    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  56.64 
 
 		 571 aa  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  56.33 
 
 		 596 aa  685    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  57.52 
 
 		 576 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  56.64 
 
 		 571 aa  683    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  70.49 
 
 		 579 aa  870    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  55.66 
 
 		 579 aa  672    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  55.52 
 
 		 590 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  56.64 
 
 		 571 aa  683    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  57.35 
 
 		 576 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  58.27 
 
 		 588 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  57.27 
 
 		 570 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  53.05 
 
 		 577 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  53.48 
 
 		 584 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  47.32 
 
 		 566 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  47.67 
 
 		 559 aa  560  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  45.66 
 
 		 569 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  27.32 
 
 		 691 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  35.03 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  33.52 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.53 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.96 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  36.88 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.2 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  32.6 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  33.74 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  32.72 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  32.12 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  32.76 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  31.61 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  24.71 
 
 		 473 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.71 
 
 		 473 aa  67  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 		 476 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.71 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.73 
 
 		 474 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  24.14 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  33.77 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.29 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  32.02 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  34.42 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.48 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.71 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  34.16 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.91 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.71 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.18 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.32 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  31.17 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  31.18 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  31.65 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.37 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  34.65 
 
 		 465 aa  62  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  24.42 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  31.71 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  32.08 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.13 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  31.01 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  31.17 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  31.61 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  28.41 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  30.92 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  31.82 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  30.92 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  26.97 
 
 		 176 aa  58.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>