93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1315 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  70.97 
 
 		 571 aa  865    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  64.27 
 
 		 579 aa  746    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  70.97 
 
 		 571 aa  867    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  70.62 
 
 		 571 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  68.28 
 
 		 570 aa  812    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  68.1 
 
 		 570 aa  811    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  60.56 
 
 		 584 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  63.86 
 
 		 571 aa  762    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  71.28 
 
 		 566 aa  863    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  70.97 
 
 		 571 aa  865    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  70.8 
 
 		 571 aa  863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  54.99 
 
 		 577 aa  674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  67.92 
 
 		 570 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  55.83 
 
 		 579 aa  688    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  55.88 
 
 		 590 aa  676    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  60.64 
 
 		 590 aa  698    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  71.1 
 
 		 588 aa  859    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  70.8 
 
 		 571 aa  865    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  62.08 
 
 		 579 aa  745    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  59.12 
 
 		 568 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  70.59 
 
 		 576 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  70.41 
 
 		 576 aa  854    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  70.77 
 
 		 576 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  55.63 
 
 		 567 aa  679    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  56.15 
 
 		 577 aa  696    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  70.59 
 
 		 576 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  70.59 
 
 		 576 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  70.97 
 
 		 571 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  60.56 
 
 		 596 aa  748    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  70.8 
 
 		 571 aa  865    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  57.86 
 
 		 563 aa  702    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 585 aa  1218    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  57.52 
 
 		 568 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  70.8 
 
 		 571 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  61.25 
 
 		 563 aa  733    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  58.13 
 
 		 569 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  61.9 
 
 		 579 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  50.54 
 
 		 559 aa  609  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  46.25 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  45.91 
 
 		 569 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  32.48 
 
 		 691 aa  213  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  30.26 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.84 
 
 		 476 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.68 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  29.89 
 
 		 474 aa  53.9  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.45 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.68 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.72 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  30.99 
 
 		 477 aa  50.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  26.99 
 
 		 473 aa  50.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  26.99 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.58 
 
 		 519 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  31.25 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.99 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  30.57 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.38 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.3 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.19 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  32.77 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.06 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 		 524 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  27.81 
 
 		 470 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  31.41 
 
 		 480 aa  47.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  27.49 
 
 		 475 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  27.81 
 
 		 470 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  24.14 
 
 		 480 aa  47  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.67 
 
 		 493 aa  47  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  29.19 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  26.63 
 
 		 473 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.35 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  27.47 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.42 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  26.04 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  26.04 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.77 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.77 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.45 
 
 		 475 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  26.04 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  26.04 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  26.04 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 		 480 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  32.98 
 
 		 476 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4473  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.47 
 
 		 450 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.04 
 
 		 493 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  28.3 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  24.36 
 
 		 468 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>