More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3158 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 473 aa  964    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.1 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7432  FAD linked oxidase-like  39.19 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6023  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 		 472 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5658  FAD linked oxidase-like  39.43 
 
 		 472 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658041  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.6 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0299284 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6514  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0813577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.7 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 		 476 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.55 
 
 		 479 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.73 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.19 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.96 
 
 		 480 aa  228  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  36.29 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 		 489 aa  223  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.88 
 
 		 468 aa  222  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  35.04 
 
 		 468 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.54 
 
 		 483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  34.1 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 		 471 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.75 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  33.75 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.96 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  35.36 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.16 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  34.1 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  34.04 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  33.98 
 
 		 484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  33.81 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.9 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  34.89 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  34.76 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  33.05 
 
 		 470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  32.95 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  32.23 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  34.86 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  32.23 
 
 		 470 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  33.97 
 
 		 473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.1 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.49 
 
 		 519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.97 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  33.18 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  35.59 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.1 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  36.53 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  33.26 
 
 		 557 aa  209  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 		 481 aa  210  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.66 
 
 		 481 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.77 
 
 		 464 aa  209  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  34.09 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  34.32 
 
 		 524 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.12 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.56 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  35.16 
 
 		 473 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.32 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  35.12 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  34.09 
 
 		 471 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.06 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  35.09 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  34.93 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  34.93 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  34.93 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  34.93 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  34.93 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  34.09 
 
 		 473 aa  206  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  34.32 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  34.97 
 
 		 475 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.77 
 
 		 474 aa  203  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.25 
 
 		 475 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  34.53 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  32.71 
 
 		 474 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  35.03 
 
 		 489 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  33.9 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.57 
 
 		 470 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 		 491 aa  199  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.56 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39945  predicted protein  34.07 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  33.82 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.52 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  32.96 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.93 
 
 		 483 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  33.54 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  35.07 
 
 		 480 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  33.26 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  34.71 
 
 		 475 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  31.66 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  31.35 
 
 		 537 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.49 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>