68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01443 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  57.55 
 
 		 576 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  58.09 
 
 		 571 aa  684    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  58.27 
 
 		 571 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  60.07 
 
 		 566 aa  710    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  58.11 
 
 		 571 aa  666    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  58.35 
 
 		 570 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  58.53 
 
 		 570 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  58.45 
 
 		 571 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  58.09 
 
 		 571 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  54.5 
 
 		 579 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  58.27 
 
 		 571 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  57.73 
 
 		 576 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  58.45 
 
 		 571 aa  688    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  57.73 
 
 		 576 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 567 aa  1180    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  54.47 
 
 		 577 aa  661    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  57.73 
 
 		 576 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  57.73 
 
 		 576 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  58.27 
 
 		 571 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  58.45 
 
 		 571 aa  688    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  53.65 
 
 		 563 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  55.63 
 
 		 585 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  61.09 
 
 		 568 aa  741    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  58.17 
 
 		 570 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  58.45 
 
 		 571 aa  688    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  54.95 
 
 		 579 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  59.08 
 
 		 577 aa  725    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  64.62 
 
 		 590 aa  766    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  59.17 
 
 		 588 aa  695    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  54.14 
 
 		 579 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  53.62 
 
 		 579 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  53.79 
 
 		 596 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  52.76 
 
 		 563 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  52.8 
 
 		 569 aa  616  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  53.08 
 
 		 590 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  52.14 
 
 		 584 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  53.38 
 
 		 568 aa  595  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  49.55 
 
 		 566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  50.64 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  45.47 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  26.18 
 
 		 691 aa  173  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.96 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.64 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.14 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  26.44 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.26 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 460 aa  50.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  24.57 
 
 		 489 aa  50.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.26 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  22.59 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  30.3 
 
 		 492 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  26.29 
 
 		 477 aa  47.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  27.72 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  28.29 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  27.72 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  27.53 
 
 		 470 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.77 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 480 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  26.62 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 		 470 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 459 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  28.04 
 
 		 481 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  25.5 
 
 		 176 aa  44.3  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 		 489 aa  44.3  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  27.43 
 
 		 470 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.39 
 
 		 495 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.39 
 
 		 495 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.39 
 
 		 475 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>