128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46664 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  100 
 
 		 691 aa  1435    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  32.48 
 
 		 585 aa  214  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  28.95 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  27.38 
 
 		 568 aa  200  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  29.8 
 
 		 570 aa  198  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  29.8 
 
 		 570 aa  198  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  26.88 
 
 		 577 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  29.78 
 
 		 579 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  29.64 
 
 		 570 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  28.03 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  29.58 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  28.6 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  30.08 
 
 		 596 aa  196  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  27.32 
 
 		 577 aa  193  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  28.12 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  29.93 
 
 		 579 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  28.83 
 
 		 576 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  28.83 
 
 		 576 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  28.83 
 
 		 576 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  28.83 
 
 		 576 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  28.83 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  27.85 
 
 		 571 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  28.38 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  29.27 
 
 		 588 aa  184  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  28.95 
 
 		 571 aa  183  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  28.78 
 
 		 571 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  28.78 
 
 		 571 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  28.78 
 
 		 571 aa  181  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  27.1 
 
 		 590 aa  181  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  28.78 
 
 		 571 aa  181  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  28.78 
 
 		 571 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  28.78 
 
 		 571 aa  181  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  28.62 
 
 		 571 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  28.26 
 
 		 569 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  28.62 
 
 		 571 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  28.4 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  27.79 
 
 		 566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  26.18 
 
 		 567 aa  174  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  27.05 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  29.88 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  25.89 
 
 		 559 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  34.62 
 
 		 477 aa  72  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  36.07 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  31.94 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.65 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 		 474 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  35.71 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  34.43 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.61 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 		 479 aa  57  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.36 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  41.67 
 
 		 469 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.17 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  35.59 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.51 
 
 		 483 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36 
 
 		 456 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  35.59 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  35.59 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  35.59 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  35.59 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  35.59 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  35.71 
 
 		 473 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 473 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.4 
 
 		 473 aa  55.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 487 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  36.46 
 
 		 472 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  34.92 
 
 		 473 aa  54.3  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  31.5 
 
 		 475 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 		 457 aa  54.3  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.38 
 
 		 475 aa  53.9  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.35 
 
 		 459 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  27.43 
 
 		 460 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.39 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  31.01 
 
 		 472 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 473 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 		 468 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.8 
 
 		 568 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 552 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 		 473 aa  51.6  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  34.4 
 
 		 476 aa  51.2  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  29.38 
 
 		 475 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.28 
 
 		 474 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.25 
 
 		 468 aa  50.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.52 
 
 		 480 aa  50.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.85 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.21 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  31.11 
 
 		 557 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.15 
 
 		 470 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  31.5 
 
 		 475 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  30.89 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  30.12 
 
 		 469 aa  49.7  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.51 
 
 		 506 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  29.9 
 
 		 176 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.46 
 
 		 469 aa  49.7  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>