110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13031 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 566 aa  1167    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  48.92 
 
 		 566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  49.55 
 
 		 567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  47.32 
 
 		 577 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  49.02 
 
 		 570 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  49.02 
 
 		 570 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  48.82 
 
 		 568 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  48.67 
 
 		 570 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  48.43 
 
 		 590 aa  553  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  46.96 
 
 		 579 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 576 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  46.25 
 
 		 585 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  46.29 
 
 		 576 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  46.47 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  47.24 
 
 		 563 aa  541  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  47 
 
 		 577 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  46.29 
 
 		 571 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  46.69 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  46.29 
 
 		 571 aa  541  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  46.47 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  46.29 
 
 		 571 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  46.29 
 
 		 571 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  46.29 
 
 		 571 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  45.77 
 
 		 579 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  45.03 
 
 		 579 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  45.93 
 
 		 588 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  46.5 
 
 		 563 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  45.18 
 
 		 579 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  45.57 
 
 		 569 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  46.32 
 
 		 596 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  44.46 
 
 		 590 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  44.34 
 
 		 584 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  43.55 
 
 		 568 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  42.58 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  37.63 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  27.79 
 
 		 691 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1170  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 		 529 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  28.57 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.3 
 
 		 497 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2502  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.92 
 
 		 482 aa  50.8  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.207618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  27.16 
 
 		 500 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.16 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.86 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.86 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.67 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.38 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.92 
 
 		 496 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.39 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.62 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  32.65 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0433  FAD linked oxidase-like  24.69 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 497 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  25.77 
 
 		 504 aa  48.5  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.77 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  33.09 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  27.67 
 
 		 497 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.42 
 
 		 499 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 484 aa  47.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  25.66 
 
 		 503 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  25.62 
 
 		 497 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1192  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  26.99 
 
 		 484 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0293  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.07 
 
 		 500 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.78 
 
 		 497 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  27.33 
 
 		 499 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  27.92 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  26.42 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  22.73 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.16 
 
 		 485 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0606  FAD linked oxidase-like  25.61 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  22.73 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.73 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  26.42 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.73 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  29.17 
 
 		 176 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  24.53 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  25.95 
 
 		 498 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 486 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.22 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.69 
 
 		 494 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.59 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>