145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 
569 aa  1162    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  49.38 
 
 
579 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  48.39 
 
 
563 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  47.22 
 
 
563 aa  556  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  50 
 
 
579 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  49.18 
 
 
579 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  49.91 
 
 
569 aa  544  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  50 
 
 
590 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  45.66 
 
 
577 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  45.92 
 
 
579 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  47.4 
 
 
576 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  48.57 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  47.4 
 
 
576 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  47.4 
 
 
576 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  47.22 
 
 
576 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  47.4 
 
 
576 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  46.22 
 
 
588 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  45.91 
 
 
585 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  45.96 
 
 
571 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  45.96 
 
 
571 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  45.96 
 
 
571 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  46.14 
 
 
571 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  45.69 
 
 
570 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  46.14 
 
 
571 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  45.88 
 
 
566 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  49.19 
 
 
584 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  45.52 
 
 
570 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  45.69 
 
 
570 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  46.14 
 
 
571 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  46.14 
 
 
571 aa  519  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  50.45 
 
 
568 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  46.14 
 
 
571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  46.14 
 
 
571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  45.47 
 
 
567 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  46.25 
 
 
571 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  43.99 
 
 
568 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 
577 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  43.26 
 
 
590 aa  481  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  39.82 
 
 
559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  37.63 
 
 
566 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  28.26 
 
 
691 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  35.06 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  31.87 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  32.91 
 
 
472 aa  67  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 
470 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.1 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.11 
 
 
474 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 
477 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  31.93 
 
 
474 aa  59.7  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 
519 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.05 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 
481 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  31.1 
 
 
474 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  29.71 
 
 
176 aa  58.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  33.97 
 
 
478 aa  57.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  32.48 
 
 
470 aa  57.4  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 
473 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  31.25 
 
 
470 aa  57  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  26.63 
 
 
524 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  29.52 
 
 
478 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  29.56 
 
 
475 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  32.48 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.58 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  26.54 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
479 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  28.66 
 
 
480 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
473 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  29.27 
 
 
489 aa  54.7  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
473 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  25.16 
 
 
473 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  30.92 
 
 
475 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 
473 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
473 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
473 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
473 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
473 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  29.09 
 
 
489 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.48 
 
 
472 aa  53.5  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 
470 aa  53.9  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  24.52 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  29.68 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.01 
 
 
474 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 
480 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 
473 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.41 
 
 
472 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.44 
 
 
468 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  29.34 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  29.87 
 
 
470 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  30.57 
 
 
480 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 
475 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  31.48 
 
 
473 aa  51.2  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.25 
 
 
480 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.52 
 
 
470 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32 
 
 
456 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 
502 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
1032 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 
489 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.45 
 
 
491 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>