206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2160 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  61.16 
 
 		 576 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  59.93 
 
 		 571 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  59.93 
 
 		 571 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  88.75 
 
 		 579 aa  1075    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  59.93 
 
 		 571 aa  729    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  59.71 
 
 		 571 aa  708    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  59.82 
 
 		 571 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  60 
 
 		 571 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  62.72 
 
 		 566 aa  745    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  69.29 
 
 		 579 aa  824    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  61.9 
 
 		 585 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  61.16 
 
 		 576 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  54.95 
 
 		 567 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  60 
 
 		 571 aa  728    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  65.64 
 
 		 568 aa  731    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 579 aa  1201    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  59.25 
 
 		 563 aa  709    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  57.09 
 
 		 577 aa  692    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  60 
 
 		 571 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  60.5 
 
 		 563 aa  736    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  64.03 
 
 		 569 aa  754    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  65.67 
 
 		 596 aa  791    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  54.45 
 
 		 577 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  54.22 
 
 		 568 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  61.16 
 
 		 570 aa  739    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  63.32 
 
 		 584 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  55.26 
 
 		 579 aa  668    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  61.16 
 
 		 576 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  60 
 
 		 571 aa  728    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  59.82 
 
 		 571 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  61.36 
 
 		 588 aa  735    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  65.28 
 
 		 590 aa  754    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  61.34 
 
 		 570 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  61.34 
 
 		 570 aa  740    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  55.47 
 
 		 590 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  61.16 
 
 		 576 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  61.16 
 
 		 576 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  49.38 
 
 		 569 aa  558  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  47.57 
 
 		 559 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  45.77 
 
 		 566 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  28.95 
 
 		 691 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  38.04 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.42 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  35.9 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.88 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.3 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  31.82 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  33.14 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  34.88 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.88 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.26 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.38 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  37.11 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  34.92 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  36.28 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30.19 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.94 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.03 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  27.44 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.05 
 
 		 473 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.25 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  29.87 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  26.83 
 
 		 473 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.75 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.9 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.32 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  31.91 
 
 		 476 aa  55.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  34.68 
 
 		 471 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.54 
 
 		 472 aa  54.7  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  30 
 
 		 472 aa  54.3  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.33 
 
 		 464 aa  53.9  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  28.39 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.93 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  30.4 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 478 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.13 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  29.03 
 
 		 478 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.58 
 
 		 475 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  23.84 
 
 		 524 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  27.04 
 
 		 469 aa  51.6  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.56 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  23.84 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.59 
 
 		 457 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  23.84 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.57 
 
 		 486 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>