More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4328 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
475 aa  929    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.95 
 
 
473 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7432  FAD linked oxidase-like  37.8 
 
 
472 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  38.81 
 
 
468 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6514  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.89 
 
 
472 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0813577  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.12 
 
 
469 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0299284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.12 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  35.97 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 
489 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6023  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5658  FAD linked oxidase-like  36.43 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  36.79 
 
 
472 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.47 
 
 
475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 
474 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.47 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.4 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.55 
 
 
489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  39.45 
 
 
489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.72 
 
 
472 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  36.08 
 
 
480 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  38.44 
 
 
465 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 
480 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 
462 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  35.79 
 
 
478 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.55 
 
 
483 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.73 
 
 
471 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.32 
 
 
481 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.4 
 
 
498 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  34.75 
 
 
473 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  33.72 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.39 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  39.28 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.09 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.75 
 
 
483 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  34.53 
 
 
470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.08 
 
 
464 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  33.78 
 
 
474 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.94 
 
 
470 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  33.77 
 
 
470 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  30.26 
 
 
470 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 
496 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  37.35 
 
 
468 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  29.16 
 
 
472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  30.26 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.84 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 
465 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.01 
 
 
470 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  35.38 
 
 
469 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  33.26 
 
 
477 aa  190  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
470 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 
465 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.79 
 
 
473 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.65 
 
 
472 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 
470 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.84 
 
 
519 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
471 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.54 
 
 
479 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.4 
 
 
472 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 
469 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  31.24 
 
 
470 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  35.19 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.13 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04140  hypothetical protein  28.2 
 
 
464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  33.04 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  28.2 
 
 
464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  34.57 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.2 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.59 
 
 
473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4231  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.12 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.78 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  34.65 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.48 
 
 
473 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  34.25 
 
 
472 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.61 
 
 
472 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 
465 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.37 
 
 
464 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  32.16 
 
 
523 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
470 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.87 
 
 
472 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  35.03 
 
 
472 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  34.38 
 
 
473 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.23 
 
 
464 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  34.45 
 
 
473 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  36.22 
 
 
476 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.22 
 
 
476 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.45 
 
 
473 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 
472 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  36.98 
 
 
476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.71 
 
 
475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.33 
 
 
474 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  33.9 
 
 
472 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  33.9 
 
 
472 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.79 
 
 
491 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 
473 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  29.06 
 
 
455 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.18 
 
 
473 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0568  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 
504 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>