102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1364 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  71.63 
 
 		 571 aa  855    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  71.63 
 
 		 571 aa  855    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  62.72 
 
 		 579 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  59.89 
 
 		 563 aa  733    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  61.79 
 
 		 569 aa  734    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  70.11 
 
 		 588 aa  846    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  61.72 
 
 		 590 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  59.34 
 
 		 590 aa  701    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  58.87 
 
 		 579 aa  711    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  73.54 
 
 		 570 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  58.06 
 
 		 577 aa  691    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  71.28 
 
 		 571 aa  850    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  71.45 
 
 		 571 aa  853    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 566 aa  1178    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  67.09 
 
 		 571 aa  788    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  58.87 
 
 		 584 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  74.07 
 
 		 570 aa  879    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  73.72 
 
 		 570 aa  875    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  71.45 
 
 		 571 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  71.1 
 
 		 571 aa  851    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  63.88 
 
 		 579 aa  776    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  71.45 
 
 		 571 aa  853    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  63.31 
 
 		 579 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  61.96 
 
 		 568 aa  717    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  71.89 
 
 		 576 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  71.53 
 
 		 576 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  71.71 
 
 		 576 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  60.07 
 
 		 567 aa  710    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  60.18 
 
 		 577 aa  728    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  71.89 
 
 		 576 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  71.89 
 
 		 576 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  71.45 
 
 		 571 aa  853    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  62.01 
 
 		 596 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  71.63 
 
 		 571 aa  855    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  59.89 
 
 		 563 aa  724    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  71.28 
 
 		 585 aa  863    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  59.32 
 
 		 568 aa  711    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  50 
 
 		 559 aa  596  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  48.92 
 
 		 566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  45.88 
 
 		 569 aa  519  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  29.58 
 
 		 691 aa  196  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  31.43 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  31.21 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.88 
 
 		 476 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.88 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  31.25 
 
 		 472 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 473 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 472 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  27.78 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  27.78 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.32 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.56 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  29.27 
 
 		 470 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  27.44 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.16 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.34 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.67 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.16 
 
 		 473 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  28.49 
 
 		 470 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 495 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  26.32 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  29.56 
 
 		 489 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.5 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.83 
 
 		 456 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.75 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.16 
 
 		 472 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  31.48 
 
 		 479 aa  47.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.75 
 
 		 463 aa  47  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  28.66 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.94 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.39 
 
 		 469 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.49 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  27.49 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  27.54 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  30.37 
 
 		 470 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 		 480 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  24.22 
 
 		 524 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.58 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  28.57 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 		 176 aa  44.3  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  32.7 
 
 		 473 aa  44.3  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.31 
 
 		 928 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.29 
 
 		 488 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.65 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>