54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C33 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 559 aa  1155    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  53.23 
 
 		 588 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  52.51 
 
 		 571 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 576 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 576 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 576 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 576 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 571 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  52.33 
 
 		 571 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  52.15 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  52.15 
 
 		 576 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  52.33 
 
 		 571 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  52.15 
 
 		 571 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 571 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  50.54 
 
 		 585 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  52.32 
 
 		 563 aa  599  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  50 
 
 		 566 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  50.63 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  50.89 
 
 		 579 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  48.04 
 
 		 579 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  49.1 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  49.1 
 
 		 570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  49.64 
 
 		 563 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  48.74 
 
 		 570 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  50.64 
 
 		 567 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  49.01 
 
 		 568 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  49.09 
 
 		 590 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  47.23 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  47.67 
 
 		 577 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  47.57 
 
 		 579 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  46.87 
 
 		 596 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  47.62 
 
 		 590 aa  549  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  46.88 
 
 		 584 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  47.58 
 
 		 569 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  47.76 
 
 		 577 aa  545  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  46.18 
 
 		 568 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  42.58 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  39.82 
 
 		 569 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  25.89 
 
 		 691 aa  154  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  28.4 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.03 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0553  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 		 460 aa  51.2  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.812155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  28.1 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.87 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 496 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  28.92 
 
 		 468 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  24.84 
 
 		 480 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.22 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>