More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0553 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0553  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  935    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.812155  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0902  FAD linked oxidase domain protein  53.56 
 
 		 467 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  39.21 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 		 509 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.56 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  40.98 
 
 		 499 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  38.75 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.46 
 
 		 497 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.69 
 
 		 499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.43 
 
 		 484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  40.43 
 
 		 495 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  39.37 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  39.35 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  38.89 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.74 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.74 
 
 		 497 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  40.51 
 
 		 499 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.69 
 
 		 502 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  39.7 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  39.04 
 
 		 499 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 		 486 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  39.96 
 
 		 497 aa  299  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  39.52 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  38.76 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  40.18 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  39.87 
 
 		 497 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 		 497 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 		 497 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  39.49 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  39.09 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  38.58 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  39.09 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.09 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  38.39 
 
 		 503 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.26 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  39.09 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  39.09 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.03 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  39.09 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  39.04 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  39.09 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.76 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  39.3 
 
 		 499 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.73 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  38.43 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.73 
 
 		 488 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.09 
 
 		 499 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.09 
 
 		 497 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  38.84 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  38.84 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  37.28 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  37.94 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.53 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  38.68 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  37.92 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.53 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 		 483 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.73 
 
 		 488 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0690  FAD linked oxidase-like  38.94 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.895548  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.89 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  39.31 
 
 		 503 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  40.62 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 		 501 aa  289  8e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.96 
 
 		 501 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.5 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.5 
 
 		 494 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  37.72 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  37.5 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  37.64 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.13 
 
 		 498 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.99 
 
 		 495 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.07 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.07 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.99 
 
 		 495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.07 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.07 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.74 
 
 		 498 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.27 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  37.27 
 
 		 497 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1192  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.84 
 
 		 497 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  40.09 
 
 		 497 aa  286  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.53 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.13 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  40.65 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.62 
 
 		 459 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  37.59 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.55 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.27 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2502  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.69 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.207618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.64 
 
 		 485 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.04 
 
 		 497 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.66 
 
 		 497 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.78 
 
 		 497 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  36.3 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>