125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1514 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  99.82 
 
 		 571 aa  1191    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  99.82 
 
 		 571 aa  1191    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  56.89 
 
 		 563 aa  687    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  99.82 
 
 		 571 aa  1191    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  60 
 
 		 579 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  60.74 
 
 		 596 aa  738    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  59.19 
 
 		 563 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  60.64 
 
 		 569 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  86.14 
 
 		 588 aa  1052    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  58.75 
 
 		 590 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  58.24 
 
 		 568 aa  695    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  57.69 
 
 		 590 aa  678    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  70.62 
 
 		 585 aa  870    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  55.04 
 
 		 579 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  65.2 
 
 		 570 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  56.09 
 
 		 577 aa  674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  99.3 
 
 		 571 aa  1186    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  99.47 
 
 		 571 aa  1187    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  71.45 
 
 		 566 aa  861    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  63.83 
 
 		 571 aa  760    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  58.01 
 
 		 584 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  65.2 
 
 		 570 aa  792    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  65.38 
 
 		 570 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 571 aa  1192    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  99.12 
 
 		 571 aa  1185    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  64.08 
 
 		 579 aa  775    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  99.47 
 
 		 571 aa  1187    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  62.08 
 
 		 579 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  59.01 
 
 		 568 aa  674    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  91.56 
 
 		 576 aa  1098    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  91.39 
 
 		 576 aa  1096    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  91.74 
 
 		 576 aa  1100    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  58.45 
 
 		 567 aa  688    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  56.64 
 
 		 577 aa  692    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  91.56 
 
 		 576 aa  1098    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  91.56 
 
 		 576 aa  1098    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  99.3 
 
 		 571 aa  1186    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  52.15 
 
 		 559 aa  624  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  46.14 
 
 		 569 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  28.95 
 
 		 691 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  34.5 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  35.06 
 
 		 489 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.09 
 
 		 474 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.39 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.13 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.12 
 
 		 476 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  27.33 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.7 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.49 
 
 		 481 aa  57  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  30.51 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  29.63 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 474 aa  54.7  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  32.9 
 
 		 480 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  30.51 
 
 		 472 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  27.33 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  31.74 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.71 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 		 475 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  32.05 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  26.71 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  27.85 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  30.43 
 
 		 470 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 		 472 aa  51.2  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.3 
 
 		 519 aa  50.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.51 
 
 		 472 aa  50.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  25.73 
 
 		 524 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  25.73 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  27.51 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  25.73 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  29.45 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  25.73 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  25.73 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  25.73 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  25.73 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.35 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.2 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  28.74 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  31.53 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10162  oxidoreductase  30.06 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.26 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.84 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 473 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  28.93 
 
 		 470 aa  47.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.28 
 
 		 472 aa  47.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2035  FAD linked oxidase-like protein  37 
 
 		 451 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.84 
 
 		 473 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2081  FAD linked oxidase domain-containing protein  37 
 
 		 451 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  37 
 
 		 451 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.633702  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 476 aa  47.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.47 
 
 		 506 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.56 
 
 		 477 aa  47.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 509 aa  47  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>