115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05675 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  56.09 
 
 		 571 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  56.09 
 
 		 571 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  54.99 
 
 		 585 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  54.45 
 
 		 579 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  56.12 
 
 		 588 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  60.94 
 
 		 590 aa  743    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  56.48 
 
 		 570 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 577 aa  1203    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  55.73 
 
 		 571 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  55.91 
 
 		 571 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  58.06 
 
 		 566 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  57.58 
 
 		 571 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  56.84 
 
 		 570 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  56.84 
 
 		 570 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  56.09 
 
 		 571 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  55.73 
 
 		 571 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  55.73 
 
 		 579 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  55.91 
 
 		 571 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  55.04 
 
 		 579 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  55.2 
 
 		 576 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  55.2 
 
 		 576 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  55.2 
 
 		 576 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  59.08 
 
 		 567 aa  725    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  55.2 
 
 		 576 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  55.2 
 
 		 576 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  55.91 
 
 		 571 aa  672    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  52.66 
 
 		 596 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  88.56 
 
 		 568 aa  1068    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  56.09 
 
 		 571 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  53.05 
 
 		 577 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  52.41 
 
 		 563 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  53.12 
 
 		 563 aa  623  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  53.69 
 
 		 584 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  51.07 
 
 		 569 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  52.6 
 
 		 590 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  51.55 
 
 		 579 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  52.69 
 
 		 568 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  47.76 
 
 		 559 aa  545  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  47 
 
 		 566 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  43.09 
 
 		 569 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  26.88 
 
 		 691 aa  198  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  28.81 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  28.82 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.92 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.42 
 
 		 482 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  27.22 
 
 		 495 aa  54.3  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 477 aa  53.9  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  29.52 
 
 		 481 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.93 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0923  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0282812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  29.22 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0884  FAD linked oxidase domain protein  27.88 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  27.11 
 
 		 477 aa  50.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.38 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.88 
 
 		 483 aa  50.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0859  FAD linked oxidase domain protein  27.05 
 
 		 477 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.38 
 
 		 495 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.73 
 
 		 485 aa  50.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.57 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  31.17 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.64 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  29.52 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.53 
 
 		 498 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.09 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.65 
 
 		 472 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.85 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  25.93 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25.9 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  30.71 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.5 
 
 		 459 aa  48.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 502 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.49 
 
 		 474 aa  47.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.39 
 
 		 493 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.25 
 
 		 460 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.38 
 
 		 494 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  26.7 
 
 		 487 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.25 
 
 		 484 aa  47  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.46 
 
 		 485 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  25.75 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.11 
 
 		 498 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.11 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.88 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.84 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39945  predicted protein  30 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.34 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  26.63 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.69 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  26.09 
 
 		 476 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0553  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.09 
 
 		 460 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.812155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.95 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.15 
 
 		 465 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.55 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  26.28 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.49 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>