140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2513 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  91.74 
 
 		 571 aa  1080    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  91.74 
 
 		 571 aa  1080    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  62.17 
 
 		 596 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  57.5 
 
 		 563 aa  691    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  91.92 
 
 		 571 aa  1081    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  57.53 
 
 		 568 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  99.65 
 
 		 576 aa  1199    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  61.16 
 
 		 579 aa  742    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 576 aa  1205    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  59.29 
 
 		 563 aa  720    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  61.5 
 
 		 569 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  91.74 
 
 		 571 aa  1080    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  57.35 
 
 		 577 aa  704    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  70.59 
 
 		 585 aa  857    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 576 aa  1205    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  86.24 
 
 		 588 aa  1055    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  59.11 
 
 		 590 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  57.88 
 
 		 590 aa  678    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  56.37 
 
 		 579 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  57.73 
 
 		 567 aa  684    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  67.19 
 
 		 570 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  55.2 
 
 		 577 aa  673    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  60.57 
 
 		 568 aa  680    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  91.92 
 
 		 571 aa  1081    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  92.09 
 
 		 571 aa  1083    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  71.89 
 
 		 566 aa  858    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  63.84 
 
 		 571 aa  763    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  57.77 
 
 		 584 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  67.19 
 
 		 570 aa  807    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  67.37 
 
 		 570 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  91.56 
 
 		 571 aa  1079    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  91.74 
 
 		 571 aa  1080    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 576 aa  1205    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  99.83 
 
 		 576 aa  1205    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  64.61 
 
 		 579 aa  772    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  92.09 
 
 		 571 aa  1083    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  62.9 
 
 		 579 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  52.33 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  46.47 
 
 		 566 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  47.4 
 
 		 569 aa  538  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  28.83 
 
 		 691 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  34.5 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.88 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  28.88 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.52 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 		 502 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  32.69 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.36 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  26.63 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.7 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.41 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 		 472 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  29.63 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  34.13 
 
 		 477 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  29.44 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  33.54 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 		 480 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  28.11 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 		 478 aa  54.3  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 		 472 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.76 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.72 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.57 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  27.57 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  29.88 
 
 		 468 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 468 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  29.27 
 
 		 475 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  30 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2035  FAD linked oxidase-like protein  35.59 
 
 		 451 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2081  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.59 
 
 		 451 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.59 
 
 		 451 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.633702  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 		 519 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.82 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.3 
 
 		 475 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 457 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 476 aa  50.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  25.68 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  29.56 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  25.68 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  26.67 
 
 		 475 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  26.38 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  25.14 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  31.52 
 
 		 473 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  25.14 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  25.14 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  25.14 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  25.14 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.13 
 
 		 483 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>