99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3347 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  58.01 
 
 		 571 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  58.75 
 
 		 588 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  83.22 
 
 		 590 aa  976    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  58.04 
 
 		 570 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  57.84 
 
 		 571 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  58.01 
 
 		 571 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  58.87 
 
 		 566 aa  698    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  59.57 
 
 		 571 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 584 aa  1195    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  58.04 
 
 		 570 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  58.04 
 
 		 570 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  58.01 
 
 		 571 aa  683    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  57.84 
 
 		 571 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  61.93 
 
 		 579 aa  729    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  57.84 
 
 		 571 aa  683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  64.01 
 
 		 579 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  74.01 
 
 		 568 aa  828    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  57.77 
 
 		 576 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  57.95 
 
 		 576 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  57.77 
 
 		 576 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  57.77 
 
 		 576 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  57.77 
 
 		 576 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  58.01 
 
 		 571 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  64.22 
 
 		 596 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  57.84 
 
 		 571 aa  683    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  55.14 
 
 		 563 aa  649    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  60.56 
 
 		 585 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  63.93 
 
 		 569 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  63.32 
 
 		 579 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  57.8 
 
 		 563 aa  695    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  57.84 
 
 		 571 aa  683    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  53.48 
 
 		 577 aa  634  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  53.52 
 
 		 568 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  53.3 
 
 		 579 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  53.69 
 
 		 577 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  50.81 
 
 		 590 aa  595  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  52.14 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  46.88 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  49.19 
 
 		 569 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  44.34 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  28.4 
 
 		 691 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.67 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  33.71 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  35.12 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.88 
 
 		 476 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.95 
 
 		 519 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  29.24 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  34.12 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  28.65 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  35.58 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 		 481 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  34.3 
 
 		 474 aa  54.7  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.56 
 
 		 502 aa  54.3  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  34.36 
 
 		 967 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.9 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.59 
 
 		 480 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  28.75 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 462 aa  50.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  31.71 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  31.71 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  42.47 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  31.71 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  42.47 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  31.71 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  31.71 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 		 470 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  35.63 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.92 
 
 		 468 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  31.61 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  33.14 
 
 		 470 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.08 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 475 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.19 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.35 
 
 		 473 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  31.94 
 
 		 470 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.98 
 
 		 472 aa  47.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  31.03 
 
 		 472 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.21 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.68 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  28.48 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.8 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 967 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  38.46 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.52 
 
 		 493 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.14 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2035  FAD linked oxidase-like protein  37.5 
 
 		 451 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2081  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 451 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 451 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.633702  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.89 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.67 
 
 		 475 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  30.82 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 506 aa  43.9  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.03 
 
 		 472 aa  43.5  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>