130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1563 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  56.71 
 
 		 571 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  56.71 
 
 		 571 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  56.54 
 
 		 571 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  54.01 
 
 		 568 aa  646    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  59.25 
 
 		 579 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  71.05 
 
 		 563 aa  861    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  57.99 
 
 		 569 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  55.34 
 
 		 577 aa  670    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  56.99 
 
 		 588 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  56.63 
 
 		 590 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  57.47 
 
 		 596 aa  700    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  57.5 
 
 		 576 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  57.5 
 
 		 576 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  53.65 
 
 		 567 aa  642    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  55.31 
 
 		 590 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  55.28 
 
 		 579 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  60 
 
 		 570 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  56.71 
 
 		 571 aa  680    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  57.86 
 
 		 585 aa  702    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  56.36 
 
 		 571 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  56.54 
 
 		 571 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  59.89 
 
 		 566 aa  724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  56.94 
 
 		 571 aa  674    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  55.14 
 
 		 584 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  60.36 
 
 		 570 aa  716    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  60.18 
 
 		 570 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  56.89 
 
 		 571 aa  680    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  56.71 
 
 		 571 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  57.5 
 
 		 576 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 563 aa  1181    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  60.11 
 
 		 579 aa  711    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  56.54 
 
 		 571 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  59.07 
 
 		 579 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  57.5 
 
 		 576 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  57.5 
 
 		 576 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  55.46 
 
 		 568 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  53.12 
 
 		 577 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  49.64 
 
 		 559 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  48.39 
 
 		 569 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  46.5 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  28.6 
 
 		 691 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  31.93 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  32.92 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  31.33 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  31.79 
 
 		 477 aa  62  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.98 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  31.36 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  30.12 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.3 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  30.82 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  33.12 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  29.52 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  26.38 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.38 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  27.27 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.99 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  29.48 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  29.88 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  25.77 
 
 		 473 aa  57  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.03 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.12 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  25.93 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  28.66 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.81 
 
 		 468 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  28.92 
 
 		 470 aa  54.3  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  28.93 
 
 		 478 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.73 
 
 		 480 aa  54.3  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  29.27 
 
 		 472 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  28.03 
 
 		 475 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  33.75 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.77 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  30.82 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  28.48 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  22.8 
 
 		 483 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.15 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  33.33 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  29.63 
 
 		 474 aa  51.2  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.31 
 
 		 462 aa  51.2  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.3 
 
 		 475 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  27.04 
 
 		 474 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  26.75 
 
 		 480 aa  50.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.63 
 
 		 456 aa  50.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.12 
 
 		 482 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  32.1 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>