More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2496 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  98.25 
 
 		 400 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  100 
 
 		 400 aa  823    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  83.75 
 
 		 400 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  93.75 
 
 		 400 aa  779    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  67.7 
 
 		 400 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  62.82 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  62.82 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  58.88 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  58.02 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  57.51 
 
 		 428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  56.03 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  52.12 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  52.12 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  52.12 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  55.56 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  52.12 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  51.87 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  55.47 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  55.19 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  52.63 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  51.62 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  51.62 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  51.62 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  53.65 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  51.62 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  53.94 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  51.62 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  51.62 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  51.62 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  51.37 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  51.12 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  54.26 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  57.34 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  50.12 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  48.8 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  56.61 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  51.13 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  49 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  40.56 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  37.3 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  37.97 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  38.78 
 
 		 461 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  38.52 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  38.9 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  40.11 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  39.28 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  38.36 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  38.36 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  38.5 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  38.36 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.26 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  38.46 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  38.5 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.31 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.33 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  37.85 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.34 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  38.07 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  40.23 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  40.23 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  40.23 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  40.23 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  40.23 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  40.23 
 
 		 410 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  40.23 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  39.55 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  38.13 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  39.09 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 		 479 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  35.17 
 
 		 481 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  38.67 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  35.17 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.71 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  39.66 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  38.46 
 
 		 481 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  35.17 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.02 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  32.85 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  37.24 
 
 		 481 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  35.52 
 
 		 479 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  35.82 
 
 		 479 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  36.95 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31.56 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31.56 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.84 
 
 		 479 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  33.14 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  34.2 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  34.38 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.83 
 
 		 478 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  33.51 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.6 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.03 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.13 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.2 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  31.98 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.52 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2449  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.46 
 
 		 392 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  34.14 
 
 		 386 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>