More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2593 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
540 aa  1074    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
541 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 
541 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
541 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
541 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  45.94 
 
 
541 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 
541 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  44.73 
 
 
541 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 
541 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
541 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  42.96 
 
 
541 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
541 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
541 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  43.73 
 
 
542 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 
542 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 
541 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  45.64 
 
 
541 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  45.29 
 
 
541 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.27 
 
 
425 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  42.02 
 
 
539 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  43.55 
 
 
541 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
539 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
541 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  49.54 
 
 
541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  42.21 
 
 
541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.37 
 
 
541 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
541 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
541 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
541 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.37 
 
 
542 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  40.81 
 
 
541 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  53.16 
 
 
570 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  46.14 
 
 
546 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 
542 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 
546 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  52.12 
 
 
546 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 
539 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2997  methyl-accepting chemotaxis protein  39.44 
 
 
542 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.686035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  38.31 
 
 
542 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 
539 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 
546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 
540 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
541 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 
551 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
550 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  50.28 
 
 
550 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.26 
 
 
541 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 
558 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 
539 aa  281  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  38.45 
 
 
557 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 
638 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 
638 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 
640 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.73 
 
 
544 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.58 
 
 
638 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
634 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
619 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  38.96 
 
 
633 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 
640 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
638 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 
639 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 
647 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  38.9 
 
 
629 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 
637 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
540 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
640 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  42.66 
 
 
640 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  42.81 
 
 
647 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
739 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 
638 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
647 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.48 
 
 
638 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 
639 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
642 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 
639 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
647 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 
674 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 
639 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 
681 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
639 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  42.05 
 
 
642 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
639 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.62 
 
 
637 aa  236  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 
647 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
650 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 
653 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
543 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
540 aa  233  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  42.6 
 
 
647 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.41 
 
 
523 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  41.46 
 
 
638 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.15 
 
 
652 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 
522 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  39.78 
 
 
676 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 
636 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
541 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>