More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0460 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  96.1 
 
 
283 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  95.05 
 
 
305 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  94.35 
 
 
283 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  89.75 
 
 
284 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  86.79 
 
 
285 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  86.43 
 
 
285 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  84.23 
 
 
285 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  84.23 
 
 
285 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  55.47 
 
 
301 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  52.83 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  47.91 
 
 
295 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  46.69 
 
 
294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  48.22 
 
 
298 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  38.87 
 
 
261 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
271 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1944  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
249 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
267 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.91 
 
 
425 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.97 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.27 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  26.79 
 
 
2063 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.69 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  28.29 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  25.88 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  29.78 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  26.94 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  28.91 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  30.1 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.57 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  25.91 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  25.91 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  26.28 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.11 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.82 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1033  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.127131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.59 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.48 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  27.49 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>