63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1132 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1132  pili assembly chaperone  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4895  putative periplasmic chaperone protein  42.74 
 
 		 235 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  42.74 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4929  putative periplasmic chaperone protein  42.74 
 
 		 235 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  42.92 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1678  putative periplasmic chaperone protein  48.17 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  48.43 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.23 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  45.5 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  45.5 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1632  putative periplasmic chaperone protein  30.84 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0992283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0164  putative periplasmic chaperone protein  30.84 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3781  putative periplasmic chaperone protein  29.6 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3869  putative periplasmic chaperone protein  29.6 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0671  putative periplasmic chaperone protein  29.6 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00513818  normal  0.436881 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  27.92 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  25.84 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  27.4 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  24.35 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  23.91 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  23.91 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  23.91 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  28.12 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  23.48 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  30.27 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  30.43 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  27.54 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  29.73 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  24.79 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  24 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  26.09 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  25.26 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  26.09 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  25.22 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  25.22 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  24.07 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  24.12 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  27.42 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  24.12 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.12 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  24.12 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  25.47 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.03 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  24.12 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  25.23 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  25.65 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  25.39 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  27.27 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  25.47 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  27.43 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  23.04 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  25.71 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  24.12 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.36 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  25.47 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  24.87 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.43 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.19 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  23.61 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  23.46 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  23.43 
 
 		 243 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  24.74 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  24.74 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>