More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2790 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2790  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 668 aa  1374    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2799  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 668 aa  1374    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 668 aa  433  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.04 
 
 		 904 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.08 
 
 		 674 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.89 
 
 		 676 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.74 
 
 		 676 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.74 
 
 		 677 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.21 
 
 		 674 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.9 
 
 		 674 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.28 
 
 		 676 aa  413  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.44 
 
 		 893 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.67 
 
 		 898 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.9 
 
 		 674 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 879 aa  401  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.1 
 
 		 917 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.66 
 
 		 695 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.86 
 
 		 745 aa  389  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.92 
 
 		 901 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.4 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.31 
 
 		 893 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.51 
 
 		 899 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.97 
 
 		 900 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.06 
 
 		 1428 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 688 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.38 
 
 		 687 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.93 
 
 		 688 aa  369  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.25 
 
 		 984 aa  364  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.25 
 
 		 984 aa  364  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.79 
 
 		 688 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.03 
 
 		 906 aa  362  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.89 
 
 		 900 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.16 
 
 		 687 aa  361  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 		 689 aa  361  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.96 
 
 		 893 aa  360  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 		 1421 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 		 1432 aa  360  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.56 
 
 		 688 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.95 
 
 		 1424 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.28 
 
 		 1410 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.63 
 
 		 689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.95 
 
 		 1432 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.08 
 
 		 1406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.79 
 
 		 920 aa  357  5e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.91 
 
 		 1425 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.08 
 
 		 979 aa  356  7.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.95 
 
 		 1425 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.57 
 
 		 1000 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.12 
 
 		 886 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.28 
 
 		 1440 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.28 
 
 		 987 aa  349  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.86 
 
 		 1425 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.5 
 
 		 1432 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 994 aa  346  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.18 
 
 		 959 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.18 
 
 		 959 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.77 
 
 		 973 aa  345  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.46 
 
 		 662 aa  346  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.63 
 
 		 927 aa  344  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.82 
 
 		 686 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.48 
 
 		 979 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.88 
 
 		 947 aa  339  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.03 
 
 		 960 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.28 
 
 		 937 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.83 
 
 		 987 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.42 
 
 		 979 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 		 960 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.73 
 
 		 1004 aa  338  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.53 
 
 		 946 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.73 
 
 		 724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.64 
 
 		 888 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.49 
 
 		 949 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.73 
 
 		 960 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.27 
 
 		 959 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 		 959 aa  337  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  32.92 
 
 		 1387 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.87 
 
 		 983 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.26 
 
 		 979 aa  336  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 		 959 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  31.31 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  31.31 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  31.46 
 
 		 713 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  31.31 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 		 953 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.31 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  31.31 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.93 
 
 		 721 aa  334  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.07 
 
 		 1110 aa  334  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.53 
 
 		 966 aa  333  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.17 
 
 		 715 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.13 
 
 		 685 aa  332  1e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 		 1426 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.99 
 
 		 718 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.27 
 
 		 905 aa  331  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.17 
 
 		 983 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.71 
 
 		 1111 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.77 
 
 		 685 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.11 
 
 		 1012 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.87 
 
 		 956 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.43 
 
 		 983 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>