271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0908 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  100 
 
 		 121 aa  246  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  74.38 
 
 		 117 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  52.99 
 
 		 133 aa  121  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  54.95 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  54.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1025  cytochrome c, class I  55.34 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  52.38 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0988  cytochrome c, class I  53.4 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  50.48 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  50.48 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  50.48 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  50.48 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  50.48 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  50.48 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  50.48 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  52.13 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  50.94 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  48.62 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  50.94 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  50.94 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  50 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  48.94 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  50 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  50 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  50.56 
 
 		 219 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  48.86 
 
 		 224 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 221 aa  87.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 221 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  44.9 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  43.33 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  47.56 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  42.55 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  41.57 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  41.57 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  44.32 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  38.94 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  42.48 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  41.41 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  44.16 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  35.4 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  40.4 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  37.17 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  33.93 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  33.03 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  43.16 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  37.78 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  34.78 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  40.79 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  33.93 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.97 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  33.67 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  37.89 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  40.22 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.82 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  35.65 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  33.04 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  36.36 
 
 		 545 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  26.13 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  33.04 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  33.04 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  33.93 
 
 		 265 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  31.19 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  32.73 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  35.42 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 217 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  31.25 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>