105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4628 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  40.58 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  41.3 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  44.2 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  39.13 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  40.74 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  43.57 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  42.22 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  42.22 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  40.44 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  39.86 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  36.62 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  34.03 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.07 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.33 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.78 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.07 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  33.62 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  28.46 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  30.33 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.2 
 
 		 518 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  24.68 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  28.79 
 
 		 681 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  22.31 
 
 		 667 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.18 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  22.58 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  22.06 
 
 		 1328 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.5 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  26.92 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  28.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  28.83 
 
 		 124 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  24.59 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  23.73 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.17 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.17 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.17 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  25.78 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  22.96 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  21.88 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.89 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  22.03 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  24.41 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  21.31 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  21.43 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  23.2 
 
 		 529 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 		 529 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 		 529 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  19.35 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  24.58 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  26.98 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.12 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  24.58 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 		 529 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  26.56 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  24.62 
 
 		 736 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 		 530 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  25.41 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  25.41 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  22.22 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3649  hemerythrin-like, metal-binding  23.94 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.39 
 
 		 526 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  22.31 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  22.9 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  21.31 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.23 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  24 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  24 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  21.14 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.88 
 
 		 941 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  21.77 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.5 
 
 		 515 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  26.56 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  25.98 
 
 		 133 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  19.84 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.5 
 
 		 515 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>