108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  43.8 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.52 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.89 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  35.2 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  34.96 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.08 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  33.6 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  32.52 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.12 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  31.45 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  32.28 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.17 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.58 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  30.58 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  27.59 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  39.73 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  39.73 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  41.1 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  29.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.56 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  30.58 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.46 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  27.66 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  26.52 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  31.2 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  23.48 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  26.98 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  32.93 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  36.99 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  29.89 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  29.89 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  30.15 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  32.63 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  30.15 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  27.78 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 736 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.85 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  28.8 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.4 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  32.46 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1832  diguanylate cyclase  30.63 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.92 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  27.73 
 
 		 277 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.92 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.92 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.9 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0266  hypothetical protein  31.51 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  34.43 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  22.48 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  28.03 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  27.17 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  24.35 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  29.41 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  22.73 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  25.6 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  26.23 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  23.66 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  25.98 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  23.47 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  27.87 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  23.7 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  29.55 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  24.07 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  24.06 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  27.21 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  24.06 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3649  hemerythrin-like, metal-binding  28.12 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  26.97 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  26.98 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  27.87 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.5 
 
 		 559 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.95 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  23.73 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1660  hemerythrin HHE cation binding region  29.31 
 
 		 128 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  24.37 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  25.62 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>