173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1887 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  40.31 
 
 		 199 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  40.31 
 
 		 199 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  37.86 
 
 		 187 aa  110  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  33.81 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0044  hypothetical protein  28.47 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  34.48 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  32.54 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  32.81 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0109  hypothetical protein  35.8 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 		 518 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  28.81 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  30.53 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  24.8 
 
 		 631 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  30.25 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.64 
 
 		 941 aa  60.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  25.62 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  23.85 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  26.27 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.6 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  27.59 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  27.74 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  28.1 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  30.4 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  30.77 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  30.08 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  22.14 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  27.87 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  26.36 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  28.69 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  27.82 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  32.46 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 515 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  25.21 
 
 		 615 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  25.86 
 
 		 667 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.42 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.15 
 
 		 963 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 689 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  27.59 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  27.5 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.16 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 		 779 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  28.37 
 
 		 596 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  29.6 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 470 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  23.85 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.16 
 
 		 1004 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  23.85 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.37 
 
 		 530 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  26.45 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  28.81 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  25.55 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  26.92 
 
 		 368 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.58 
 
 		 926 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  20.49 
 
 		 531 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  25.98 
 
 		 277 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  25.4 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  25.86 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.53 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 963 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.4 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.79 
 
 		 529 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.05 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  22.22 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  27.35 
 
 		 722 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  24.79 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  26.27 
 
 		 681 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  24.79 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 722 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  27.71 
 
 		 736 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.79 
 
 		 529 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  27.27 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  25.41 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  25.93 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>