183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2241 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  94.03 
 
 		 134 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  64.93 
 
 		 138 aa  196  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  51.91 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  50.37 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  43.61 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  44.96 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  41.54 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  44.62 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  40.46 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  43.61 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  43.61 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  42.86 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  41.54 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  38.35 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  37.88 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  43.85 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  43.85 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  37.69 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  43.85 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  36.84 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  37.4 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  36.09 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  40.91 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.34 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  35.11 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.61 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  36.72 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  36.36 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  35.56 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  30.3 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  31.34 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  31.06 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  33.86 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  34.13 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 722 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 529 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  33.6 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  30.88 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 559 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  30.47 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  36.59 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 529 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 526 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.77 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 515 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 779 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 518 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  32.81 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 518 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 963 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  32.06 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 994 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  30.15 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 926 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  27.82 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 		 963 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  26.15 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  27.48 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  28.47 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  32.54 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  29.85 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  29.23 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  25.98 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  28.89 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  28.12 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>