178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1074 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 360 aa  742    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  37.21 
 
 		 135 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 579 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 722 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 		 559 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.68 
 
 		 518 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 529 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 		 529 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 529 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 518 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 518 aa  92.8  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  35.66 
 
 		 529 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  37.12 
 
 		 158 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 529 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.76 
 
 		 689 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 529 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 529 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  36.59 
 
 		 135 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 529 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 		 526 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 941 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  33.59 
 
 		 145 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  34.68 
 
 		 135 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 926 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 		 515 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 963 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 		 135 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 1032 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  32.54 
 
 		 147 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 135 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  33.58 
 
 		 135 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 963 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  32.56 
 
 		 135 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  32.28 
 
 		 132 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 997 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  32.21 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 779 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 133 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  35.38 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  35.82 
 
 		 143 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  33.88 
 
 		 135 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 927 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 		 137 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  34.62 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  27.91 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.34 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  25.93 
 
 		 152 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 994 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 736 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 		 133 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  33.59 
 
 		 153 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  28.79 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 		 615 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  32.8 
 
 		 209 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  32.37 
 
 		 157 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  29.77 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  28.89 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.46 
 
 		 135 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  28 
 
 		 135 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  33.61 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  29.41 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  29.41 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  29.29 
 
 		 160 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 138 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  31.51 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  32.54 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  28.47 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  30.07 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.94 
 
 		 1004 aa  63.9  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.16 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  31.75 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  28.91 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  33.86 
 
 		 681 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 		 161 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.82 
 
 		 138 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  26.62 
 
 		 151 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  30.95 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  29.77 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.68 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  26.56 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.35 
 
 		 662 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>