147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1871 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
138 aa  286  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  52.63 
 
 
134 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  38.93 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  34.81 
 
 
138 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  38.76 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  38.76 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.98 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  33.58 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  32.85 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  32.28 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.85 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  32.81 
 
 
470 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  33.61 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  31.39 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  38.14 
 
 
631 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  32.54 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.59 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.68 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 
144 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  34.31 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  34.31 
 
 
149 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  32.26 
 
 
529 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  32.56 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
529 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
529 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 
518 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  30.5 
 
 
360 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  26.19 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  28.36 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.28 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  31.5 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  29.6 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  25.93 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
529 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 
529 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 
529 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 
529 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
529 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  27.74 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  30.08 
 
 
213 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.2 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 
526 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 
518 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  27.13 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  29.6 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  32.09 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  32.35 
 
 
144 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  31.15 
 
 
153 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  25.36 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.86 
 
 
963 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  29.84 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  31.15 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  29.09 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  32.63 
 
 
498 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.69 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 
253 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 
515 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 
515 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1406  hemerythrin  29.13 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.039713  normal  0.0262691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  25.74 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  28.47 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  25.78 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 
559 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  28.15 
 
 
519 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  27.74 
 
 
277 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  25 
 
 
199 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 
1032 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  25 
 
 
199 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 
736 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  28.47 
 
 
155 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  24.26 
 
 
368 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  25.56 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  26.4 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  28.8 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.95 
 
 
662 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  25.98 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  27.66 
 
 
681 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  23.53 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>