127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3109 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 253 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  59.68 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.51 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 963 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 		 529 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  32.87 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 963 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  27.74 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.91 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.23 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0400  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.401585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 135 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 137 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  25.35 
 
 		 736 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 529 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  29.06 
 
 		 133 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  29.06 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  25.18 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  26.09 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  30.16 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  30.3 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  26.83 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  29.41 
 
 		 131 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  27.21 
 
 		 134 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  29.41 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  26.36 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 		 518 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  23.31 
 
 		 133 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.12 
 
 		 146 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 134 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.68 
 
 		 133 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  23.39 
 
 		 135 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 		 941 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 131 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  30.58 
 
 		 130 aa  52.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 		 518 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  25.2 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 137 aa  52  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  26.28 
 
 		 147 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 689 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 144 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  27.13 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  27.82 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  30.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.63 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  26.72 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.19 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.82 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  25.38 
 
 		 667 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 		 779 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  22.58 
 
 		 135 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  27.48 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  27.91 
 
 		 161 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 138 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  25.18 
 
 		 140 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 138 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.39 
 
 		 515 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  25.74 
 
 		 147 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.83 
 
 		 518 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 158 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.93 
 
 		 1328 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  30.51 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 		 559 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 927 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  26.12 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  25 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  26.36 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  32.47 
 
 		 90 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  26.56 
 
 		 153 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  28.46 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  24.09 
 
 		 143 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  23.81 
 
 		 132 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  25.78 
 
 		 153 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  25.4 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  22.63 
 
 		 360 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 997 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 137 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  20.74 
 
 		 134 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  31.54 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.62 
 
 		 1004 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  24.03 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>