110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0473 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 134 aa  283  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  52.63 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  36.43 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  38.06 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  38.06 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.07 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 470 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  30.47 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  31.82 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  34.65 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  34.65 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.65 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  32.06 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  26.15 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  26.15 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 963 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.38 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.69 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  25.38 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  26.15 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  27.27 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  27.56 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 		 997 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  25.38 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  28.03 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1653  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000451029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.38 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  26.19 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 927 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 529 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 529 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 529 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 529 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 559 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  28.24 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 963 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  23.62 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.37 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  26.4 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 529 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  29.69 
 
 		 736 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  31.2 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 526 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.13 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  31.33 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 529 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 529 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.29 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  21.6 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  30.39 
 
 		 631 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  25.6 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  30.71 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  27.13 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  27.07 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  24.6 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  24.8 
 
 		 529 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  24.6 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  27.78 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  24.43 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  24.22 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  23.66 
 
 		 1328 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  24.8 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.02 
 
 		 518 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 689 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  22.73 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  22.73 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>