189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0173 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
132 aa  273  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  45.8 
 
 
131 aa  129  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  45.45 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  43.61 
 
 
134 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  40.91 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  42.64 
 
 
138 aa  123  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  42.86 
 
 
134 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  36.92 
 
 
138 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.21 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.62 
 
 
138 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 
140 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  33.85 
 
 
137 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  36.51 
 
 
139 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  35.38 
 
 
133 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  35.38 
 
 
133 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  36.15 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  36.64 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  37.69 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  28.68 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  36.51 
 
 
135 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  35.38 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.48 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.06 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  30.3 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  35.71 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 
146 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.3 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  32.06 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.38 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 
963 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
518 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.25 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 
689 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
515 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
515 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  33.33 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  32.8 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  32.31 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
963 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 
518 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  28.03 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
722 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 
559 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  31.06 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  28.79 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  26.56 
 
 
529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  26.92 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
529 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 
518 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 
779 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 
526 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  30.15 
 
 
615 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 
529 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
529 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
529 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  25.76 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
529 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
529 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  33.07 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 
926 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 
529 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  33.07 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  29.69 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  27.91 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 
579 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  31.39 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  22.48 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  28.91 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
941 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.6 
 
 
530 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  25.56 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  31.25 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>