213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1324 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  64.44 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  66.67 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  44.78 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 		 994 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  45.19 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 518 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  45.52 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  42.75 
 
 		 158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  43.28 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  41.79 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 515 aa  123  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 515 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 		 518 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 		 722 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 529 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 529 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 529 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 529 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 526 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 		 579 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  37.4 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 518 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 529 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  38.35 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  40.16 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 529 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 		 689 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  37.3 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 529 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 1032 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 529 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  34.78 
 
 		 615 aa  98.2  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  34.4 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 779 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 926 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 		 941 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  34.71 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  40.3 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  31.85 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 559 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 871 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  29.2 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  34.4 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  32.23 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  32.06 
 
 		 188 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 		 927 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  32.82 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 530 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  35.88 
 
 		 192 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 		 963 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  28.03 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  30.08 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  32.31 
 
 		 667 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  30.4 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  30.95 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  33.33 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 997 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  33.86 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  32.8 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  29.55 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  30.58 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.62 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 963 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  31.85 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.83 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  39.02 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  32.81 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.34 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  27.2 
 
 		 631 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  27.01 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  31.65 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  31.11 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  28.68 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>