194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1252 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  91.85 
 
 		 137 aa  261  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  38.93 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.5 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  37.12 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  36.72 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.88 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  32.82 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  30.15 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  35.94 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  34.85 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  34.85 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  34.09 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  32.82 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  35.43 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  29.5 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.14 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  32.52 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  32.52 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  28.78 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.24 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.83 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  28.89 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  34.09 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  30.83 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  33.85 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.89 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  32.33 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  30.15 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.82 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  30.47 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  31.25 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.72 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 689 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  31.82 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  32.03 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 927 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  29.46 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  33.61 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  25.58 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  28.03 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 518 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  30.33 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 518 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  29.1 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  32.09 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  31.15 
 
 		 188 aa  67  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.97 
 
 		 559 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  28.24 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  30.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  35.9 
 
 		 722 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.79 
 
 		 722 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 529 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 526 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  27.48 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  31.5 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  29.85 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  29.01 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 		 963 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 736 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  28.12 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  24.63 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 779 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  32.56 
 
 		 871 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  28.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  31.71 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  29.79 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  29.6 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 		 926 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 		 529 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  25.78 
 
 		 529 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 941 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 		 529 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  24.63 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>