More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0400 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0400  response regulator receiver protein  100 
 
 		 320 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.401585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  35.85 
 
 		 1084 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1809  histidine kinase  46.15 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1522  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.62039e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 846 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  29.77 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  39.08 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  27.61 
 
 		 529 aa  62.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  39.08 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.79 
 
 		 518 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  40 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  22.18 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  40.66 
 
 		 1127 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 722 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1428  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 807 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  40 
 
 		 1197 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1197 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  40 
 
 		 1197 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  40 
 
 		 1197 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  40 
 
 		 1197 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.78 
 
 		 957 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 963 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.78 
 
 		 949 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.78 
 
 		 949 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  41.11 
 
 		 1197 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  42.03 
 
 		 948 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  28.46 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  41.11 
 
 		 1197 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1891  response regulator  40.54 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  36.78 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 984 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  35.56 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.77 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00212671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 126 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  37.21 
 
 		 1083 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 941 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 		 1064 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  36.14 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  33.68 
 
 		 936 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  35.48 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  27.66 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  43.66 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2633  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.94 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  41.79 
 
 		 849 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  32.99 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  38.95 
 
 		 1127 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  40.51 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 1039 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6693  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 		 933 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 		 949 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 		 949 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35.56 
 
 		 126 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 		 949 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 		 949 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1003 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 		 949 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  34.52 
 
 		 933 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  36.36 
 
 		 935 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  34.52 
 
 		 949 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.56 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  35.63 
 
 		 1053 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  27.78 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 		 949 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 		 518 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.1 
 
 		 470 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  32.14 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>