198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3068 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 133 aa  277  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  42.42 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  37.12 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  48.06 
 
 		 145 aa  117  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  47.29 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.12 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  37.4 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  36.36 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  34.35 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  37.69 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 518 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 722 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  38.64 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  35.43 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 515 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 515 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  34.4 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  33.6 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  34.92 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 		 518 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  32.8 
 
 		 135 aa  84.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 		 530 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 		 994 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  32.56 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 779 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 689 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  42.68 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 736 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  29.37 
 
 		 529 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  32.09 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 927 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  30.23 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 518 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  30.71 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 529 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 529 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 529 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 529 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 529 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 529 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 529 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 997 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  31.01 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 		 926 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 526 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  29.85 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 		 871 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 559 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 963 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  31.5 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 		 360 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  27.48 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  26.83 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  27.91 
 
 		 667 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 963 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  30.66 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  29.46 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 941 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  33.85 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  31.06 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  26.56 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2255  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  30.71 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  30.33 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  30.33 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  25.58 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  28.15 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  29.92 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  30.83 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  33.83 
 
 		 596 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  25.56 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 		 1032 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  25.4 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  26.4 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  28.36 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  31.75 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  34.21 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>