161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4300 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  32.26 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  30.65 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  33.61 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.65 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  29.84 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  31.45 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  28.69 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  33.04 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  32.28 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  31.75 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  25.62 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  29.03 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  28.35 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 
927 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
736 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  29.27 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  29.84 
 
 
213 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 
994 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  27.64 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  33.06 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  24.43 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  26.32 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1764  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.562608  normal  0.444955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  29.92 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2255  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  31.18 
 
 
631 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.64 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.23 
 
 
722 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  26.83 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.5 
 
 
779 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 
529 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  26.83 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  27.64 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 
529 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 
529 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  30.68 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 
926 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  26.02 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  25.21 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  24.22 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  35.37 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  31.54 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  26.77 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  26.61 
 
 
131 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  23.31 
 
 
188 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.97 
 
 
518 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  24.19 
 
 
135 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.77 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  24.37 
 
 
529 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  23.39 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 
360 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.93 
 
 
768 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  27.74 
 
 
368 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
1032 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  26.92 
 
 
368 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  26.45 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.21 
 
 
529 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  26.02 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.21 
 
 
529 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.17 
 
 
526 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.21 
 
 
529 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.21 
 
 
529 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.5 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.01 
 
 
515 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  24.22 
 
 
596 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.2 
 
 
518 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.01 
 
 
515 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  24.8 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  27.69 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.62 
 
 
518 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>