152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0327 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  54.26 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  29.2 
 
 		 135 aa  93.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  29.41 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  32.35 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  32.85 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  33.09 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  31.39 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.2 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 722 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  32.33 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.33 
 
 		 689 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  36.84 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  34.68 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  31.58 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 		 518 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  34.4 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  30.88 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 994 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  31.58 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  36.3 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  36.3 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  28.68 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  28.46 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.61 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  29.84 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  32.33 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  33.87 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  28.15 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  27.94 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  27.21 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  30.94 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  27.61 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0841  GGDEF family protein  31.34 
 
 		 372 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 360 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 		 526 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  28.24 
 
 		 470 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.61 
 
 		 518 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.56 
 
 		 518 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.36 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  33.6 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  33.6 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  31.16 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  32.58 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  27.48 
 
 		 188 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.54 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 		 941 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  26.47 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.99 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  24.81 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  27.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 927 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  33.06 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 1032 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  27.41 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  25.78 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 		 736 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  29.6 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  28.68 
 
 		 681 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  26.61 
 
 		 667 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.01 
 
 		 579 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  27.13 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.17 
 
 		 529 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.41 
 
 		 779 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  22.31 
 
 		 529 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.64 
 
 		 963 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 926 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  27.83 
 
 		 615 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  27.82 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  26.32 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  25.37 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  32.35 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.01 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  25.19 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>