132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2231 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 134 aa  280  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  34.75 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  38.71 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 689 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 559 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 515 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 515 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  27.78 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 963 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 963 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  33.62 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  36.28 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  37.07 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 518 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.21 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  33.93 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  31.36 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 779 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  35.09 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 941 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 518 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  33.94 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 529 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 529 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 529 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 529 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  25.4 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  30.39 
 
 		 519 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  29.17 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  28.81 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.86 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 927 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  27.69 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 		 529 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  26.45 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  29.17 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  35.4 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  30.97 
 
 		 615 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  30.53 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.36 
 
 		 526 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  24.59 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  28.57 
 
 		 529 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.18 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 529 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  32.69 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 722 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  31.75 
 
 		 470 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  28.83 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  28.45 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  28.45 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 529 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.92 
 
 		 994 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  33.02 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  30.36 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  28.1 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  32.73 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  29.73 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 		 926 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  30.09 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  25.86 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  30.17 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  29.91 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  35.14 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  28.81 
 
 		 681 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  31.2 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.91 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  31.5 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  24.59 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 1032 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  32.14 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  29.91 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  34.23 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  30.43 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.37 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  30.63 
 
 		 360 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  33.06 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  31.03 
 
 		 368 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 		 579 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 530 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 253 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>