162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2455 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  34.85 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  32.81 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  33.58 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  30.16 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  30.47 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 689 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  31.47 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 927 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  24.26 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 722 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  27.61 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  29.55 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.6 
 
 		 518 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.09 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 941 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  29.23 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  28.1 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  29.23 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.13 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  25.98 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.4 
 
 		 994 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  28.1 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.91 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 529 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.77 
 
 		 779 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  26.62 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  25 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  25.76 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 963 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 997 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 529 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  25.38 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  25.95 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  24.22 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  29.92 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.19 
 
 		 559 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  27.27 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  29.5 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 579 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.76 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  22.9 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  27.34 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.76 
 
 		 526 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  25 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  25.93 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.43 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  27.01 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  27.59 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  25.95 
 
 		 192 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  26.9 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  28.47 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  27.01 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  30.33 
 
 		 470 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  26.5 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  30.99 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  28.35 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  24.11 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 871 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 963 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  28.93 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  26.56 
 
 		 681 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  28.91 
 
 		 596 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.2 
 
 		 518 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  21.05 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  28.26 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.6 
 
 		 1004 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.19 
 
 		 518 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  26.17 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  29.37 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  23.97 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  23.26 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 1032 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  29.92 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.4 
 
 		 515 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.56 
 
 		 662 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  26.98 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>