142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0794 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  92.03 
 
 		 138 aa  261  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  79.55 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  52.5 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  49.22 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.39 
 
 		 160 aa  106  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  40.62 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  39.84 
 
 		 168 aa  97.1  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 186 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  39.55 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  42.19 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  38.76 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  38.02 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  38.28 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  38.28 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  40 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  34.04 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  36.89 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  37.7 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  32.8 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  34.71 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  39.13 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  31.2 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  34.15 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  24.29 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  24.39 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  24.81 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  29.36 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1660  hemerythrin HHE cation binding region  27.35 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  26.36 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.61 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  21.05 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  29.79 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  29.79 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  29.17 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  23.31 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 530 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  24.41 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  24.03 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  26.02 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  25.74 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  29.06 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  27.69 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 529 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  30.88 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  25.86 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 529 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 529 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 529 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  28.4 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  23.31 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  24.39 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  23.2 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.31 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.62 
 
 		 529 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 994 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  27.41 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 		 736 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.62 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 518 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.54 
 
 		 526 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.03 
 
 		 779 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  21.8 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  24.46 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  23.57 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  22.56 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  23.08 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  23.08 
 
 		 529 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  22.14 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  25.64 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 529 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.35 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  22.46 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  25.95 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  25.64 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  25.56 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  24.59 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  21.8 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.1 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>