145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0584 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  58.7 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  51.37 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  58.27 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  61.87 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  50.33 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  46.84 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  48.97 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  48.97 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  47.97 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  47.06 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  48.55 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  48.51 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  40.44 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  37.84 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  37.16 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  39.02 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  40.65 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.3 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  34.97 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  41.53 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.09 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.32 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.67 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  27.94 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  23.26 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 559 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  29.2 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 736 aa  58.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.85 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.17 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.24 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  29.55 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.24 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.24 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.24 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.24 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.24 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.24 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  26.92 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  32.33 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  34.31 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.15 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  24.82 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  29.17 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 963 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  25.66 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  26.32 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  27.82 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.55 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  31.85 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.51 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.29 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.68 
 
 		 518 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  23.26 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  21.77 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 941 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 135 aa  51.2  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  28.69 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  28.69 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  30.63 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  21.95 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  23.85 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.12 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  23.85 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  23.66 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  27.91 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 133 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 133 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  27.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  24.43 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  25.42 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 		 927 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  26.5 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.87 
 
 		 131 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.33 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  20.31 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  26.15 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  25.44 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  25.2 
 
 		 667 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.21 
 
 		 689 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.44 
 
 		 926 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>