154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1699 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  48.97 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  48.97 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  48.66 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  33.81 
 
 		 141 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  49.47 
 
 		 98 aa  96.3  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0109  hypothetical protein  51.85 
 
 		 98 aa  87.8  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0044  hypothetical protein  26.42 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  30.07 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  28.47 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  33.88 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  30.09 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  29.27 
 
 		 631 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  31.58 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0266  hypothetical protein  31.36 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  25.9 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  28.77 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.42 
 
 		 1328 aa  61.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  26.96 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  27.42 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  28.87 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  29.75 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  26.05 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  32.46 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  22.78 
 
 		 615 aa  58.9  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  29.08 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  28.1 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 997 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 871 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  27.48 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.82 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.86 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  29.37 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  27.2 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  25.62 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 		 515 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  29.17 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  27.5 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  27.5 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 		 515 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  34.43 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  31.5 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.65 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  26.5 
 
 		 667 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.47 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  34.88 
 
 		 132 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  27.97 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  27.66 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  28.91 
 
 		 470 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  25.62 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  27.83 
 
 		 722 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  24.17 
 
 		 736 aa  52.4  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  34.43 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  23.97 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.78 
 
 		 518 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.77 
 
 		 689 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  24.39 
 
 		 133 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1406  hemerythrin  27.27 
 
 		 134 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.039713  normal  0.0262691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.17 
 
 		 526 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.93 
 
 		 559 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  31.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.93 
 
 		 779 aa  51.2  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  26.52 
 
 		 140 aa  51.2  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1670  hypothetical protein  30.53 
 
 		 133 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  21.95 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.89 
 
 		 926 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  26.45 
 
 		 368 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  23.81 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  20.71 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  28.81 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  28.81 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  24.11 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  27.27 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  23.28 
 
 		 529 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.14 
 
 		 529 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.14 
 
 		 529 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.14 
 
 		 529 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  29.2 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.14 
 
 		 529 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.4 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  22.69 
 
 		 681 aa  48.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0275  diguanylate cyclase  24.43 
 
 		 630 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  26.02 
 
 		 596 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  27.16 
 
 		 531 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.28 
 
 		 529 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  23.97 
 
 		 138 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  26.45 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.28 
 
 		 529 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.28 
 
 		 529 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.55 
 
 		 518 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  28.81 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>