45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0605 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  97.32 
 
 
145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  97.32 
 
 
145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  97.32 
 
 
145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  94.63 
 
 
186 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  84.46 
 
 
141 aa  235  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  52.63 
 
 
157 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  45 
 
 
160 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 
138 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  40.8 
 
 
138 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  43.1 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  38.52 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  37.7 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  36.97 
 
 
160 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  37.19 
 
 
171 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  36.59 
 
 
168 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 
166 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.53 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  36.19 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  35.19 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  35.19 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  35.24 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  32.73 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  33.04 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  34.86 
 
 
166 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  32.41 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  33.94 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  34.15 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.86 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  37.74 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  29.92 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  33.04 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  32.08 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  28.45 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  30.48 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  28.16 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  28.44 
 
 
161 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.4 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.17 
 
 
927 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>