118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2115 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  51.37 
 
 		 165 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  49.31 
 
 		 158 aa  150  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  50.69 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  50.69 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  50 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  50.35 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  44.68 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  47.79 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  48.09 
 
 		 168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  45.27 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  40.71 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  39.13 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  38.41 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  42.37 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.84 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.29 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  37.82 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.02 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  36.97 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  37.82 
 
 		 171 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  36.13 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  31.5 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  34.55 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.77 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  29.27 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.21 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.19 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.85 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.85 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.85 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.85 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.85 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.85 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.85 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  27.05 
 
 		 667 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  24.8 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.4 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  23.26 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  23.26 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  24.64 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.54 
 
 		 997 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  24.17 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  23.44 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  23.26 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  23.91 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  30.49 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  21.37 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  20.93 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  22.4 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  20.83 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  23.68 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  22.76 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 736 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  22.76 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  21.97 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  22.76 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 		 529 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.71 
 
 		 518 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  29.23 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.4 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  27.34 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  21.67 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.22 
 
 		 526 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.31 
 
 		 515 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.91 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.66 
 
 		 779 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.49 
 
 		 515 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  23.7 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  21.6 
 
 		 519 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.61 
 
 		 689 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  27.21 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  22.03 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  23.02 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  26.47 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  23.66 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.22 
 
 		 529 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.89 
 
 		 941 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  27.21 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  23.31 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  26.47 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  30.1 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  20 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  21.71 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.22 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.31 
 
 		 518 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  22.3 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.86 
 
 		 559 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  21.88 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  21.88 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.66 
 
 		 529 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.66 
 
 		 529 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>